
<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Dear all,<div class=""><br class=""></div><div class="">Please see link below for an open PhD student position in my group at University of Copenhagen, Denmark. Application deadline: October 31, 2016.</div><div class=""><a href="http://employment.ku.dk/phd/?show=857805" class="">http://employment.ku.dk/phd/?show=857805</a></div><div class=""><br class=""></div><div class=""><b class="">Context</b><br class="">The lab of Robin Andersson focuses on genomics and computational/statistical modeling of transcriptional regulation based on large-scale sequencing data, including experimental data generated from within the lab. We aim to characterize and better understand the architectures and complexities of transcriptional regulation (see e.g. Andersson et al. 2014, Nature, <a href="http://dx.doi.org/10.1038/nature12787" class="">http://dx.doi.org/10.1038/nature12787</a>) and gain insights into the mechanisms of regulation. We further focus on the fundamental properties of enhancers and promoters (see e.g. Andersson et al. 2015, Trends Genet, http://dx.doi.org/10.1016/j.tig.2015.05.007) as well as the biogenesis and characteristics of enhancer RNAs (see e.g. Andersson et al. 2014, Nat Comms, http://dx.doi.org/10.1038/ncomms6336). The group is also active in the international FANTOM consortium and is part of the FANTOM6 project http://fantom.gsc.riken.jp/6/. For more information, see http://anderssonlab.org.<br class=""><br class=""><b class="">Project</b><br class="">The correct function of regulatory elements and their interplay are essential for the precisely coordinated transcriptional activities within a cell. Disrupted regulatory activities may therefore have detrimental effects leading to disease. However, most variants have no or an only weakly associated trait and, in general, the impact of genetic variants on regulation is not well understood. Therefore, using our established accurate transcription-based method to assess activities of regulatory elements and the associations between them, we aim to systematically characterize human regulatory variation and its consequences. We further aim to infer models describing the function of a regulatory element and its importance, and thus the impact on regulation upon disruption.<br class=""><br class="">The successful candidate is expected to work on projects related, but not limited, to 1) computational modeling of enhancer regulation and genome-wide mapping of enhancer architectures; and 2) assessment of the extent and impact of individual variation and genetic variants in regulatory architectures in order to understand their importance, stochasticity and robustness.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Best regards,</div><div class="">Robin Andersson</div><div class=""><br class=""></div><div class="">--</div><div class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Robin Andersson, PhD<br class="">Assistant professor, group leader<br class=""><br class="">The Bioinformatics Centre<br class="">Department of Biology<br class="">University of Copenhagen<br class="">Ole Maaloes Vej 5<br class="">DK-2200 Copenhagen N, Denmark<br class=""><br class=""><a href="http://anderssonlab.org" class="">http://anderssonlab.org</a><br class="">Twitter: @robin_andersson<br class="">Skype: andersson.robin</div></div></div></div></div></div></div></div>

</div>

<br class=""></body></html>