[SocBiN] Fwd: Känner du någon?

Mon Dec 3 13:34:25 CET 2012

*Positions at Smittskyddsinstitutet in Solna:*

*Bioinformatiker*

*Smittskyddsinstitutet (SMI) är en statlig myndighet under
Socialdepartementet med ansvar för smittskyddet och med ett brett
folkhälsoperspektiv. SMI ska genom kunskapsuppbyggnad och kunskapsspridning
främja befolkningens skydd mot smittsamma sjukdomar och bidra till att
landets smittskydd fungerar effektivt.*****

Avdelningen för diagnostik och vaccin söker en bioinformatiker med
placering på enheten för Support samt enheten för Diagnostik.
Supportenheten genererar bland annat analysdata för molekylär typning av
mikroorganismer med Sangersekvensering och next generation sequencing (NGS).
****

*Arbetsuppgifter**
*Dina huvuduppgifter kommer att vara arbete med avdelningens hantering av
sekvensdata samt uppbyggnad av en nationell databas för vissa specifika
smittämnen. På myndigheten sker sekvensering av bakterier, parasiter och
virus och du kommer att hantera data från både Sanger och NGS. Detta
innefattar rensning av data, genommapping, genomassembly, annotering och
jämförande genomik samt automatisering och validering av samtliga steg. Du
kommer även att vara delaktig i det ständiga förbättringsarbete som skall
genomsyra verksamheten.****

*Kompetens**
*Du har en gedigen bakgrund som bioinformatiker och erfarenhet av
uppbyggnad och underhåll av relationsdatabaser (MySQL eller motsvarande).
Det är meriterande om du har arbetat med någon av programvarorna CLC
genomics workbench eller Bionumerics. Om du inte redan har kunskaper inom
infektionsbiologi så är det viktigt att du har ett genuint intresse av att
lära dig fältet. Eftersom enheten arbetar med metodutveckling så bör du ha
god förmåga att lösa problem självständigt. Vi lägger stor vikt vid dina
personliga egenskaper och vi söker dig som är noggrann, flexibel, har goda
samarbetsegenskaper samt vilja och förmåga att dela med dig av dina
kunskaper. En naturlig drivkraft av förbättringsarbete är önskvärt. Goda
kunskaper i svenska och engelska, både muntligt och skriftligt krävs.****

*Övriga upplysningar**
*Tjänsten är en visstidsanställning på heltid i två år med tillträde enligt
överenskommelse. Vill du veta mer om tjänsten är du välkommen att kontakta
enhetschef Erland Holmberg på telefon 08-457 25 20. Fackliga företrädare är
Mathilda Lindberg, SACO, 724 77 (facket-saco at smi.se), Anita Ekner, ST, 724
50 (anita.ekner at smi.se) och Margareta Thorhagen, Vårdförbundet, 725 72 (
margareta.thorhagen at smi.se)****

Sök tjänsten via vår hemsida senaste den 21 december 2012****

*Bioinformatiker*

*Smittskyddsinstitutet (SMI) är en statlig myndighet under
Socialdepartementet med ansvar för smittskyddet och med ett brett
folkhälsoperspektiv. SMI ska genom kunskapsuppbyggnad och kunskapsspridning
främja befolkningens skydd mot smittsamma sjukdomar och bidra till att
landets smittskydd fungerar effektivt.*****

Avdelningen för diagnostik och vaccin söker bioinformatiker med placering
på enheten för support. Enheten fungerar som en supportfunktion för
myndigheten och ansvarar för sekvensering, massiv parallellsekvensering med
hjälp av next generation sequencer (NGS), PCR, rt-PCR, extraktion av
nukleinsyra, biobank, masspektrometri och provmottagning. Ytterligare roll
för enheten är att vara drivande i förbättringsarbetet rörande molekylär
diagnostik.

*Arbetsuppgifter**
*Din huvuduppgift kommer att vara arbete inom enhetens verksamhet med
sekvensering. På myndigheten sker sekvensering av bakterier, parasiter och
virus och du kommer att hantera data från både Sanger och NGS vilket
innefattar rensning av data, genommapping, genomassembly, annotering och
jämförande genomik samt automatisering och validering av samtliga steg. Du
kommer även att vara delaktig i det ständiga förbättringsarbete som skall
genomsyra verksamheten.****

*Kompetens**
*Du har en gedigen bakgrund som bioinformatiker med goda kunskaper i
programmering (minst ett av Perl/Python och/eller Java). Du kan producera
strukturerad och kvalitetssäkrad kod samt förstå kod som andra producerat.
Erfarenhet av programmering mot databas är önskvärt. Arbete med LIMS och
programmering mot instrument-APIer är mycket meriterande. Det är
meriterande om du har arbetat med någon av programvarorna CLC genomics
workbench eller Bionumerics. Om du inte redan har kunskaper inom
infektionsbiologi så är det viktigt att du har ett genuint intresse av att
lära dig fältet. Eftersom enheten arbetar med metodutveckling så bör du ha
god förmåga att lösa problem självständigt. Vi lägger stor vikt vid dina
personliga egenskaper och vi söker dig som är noggrann, flexibel, har goda
samarbetsegenskaper samt vilja och förmåga att dela med dig av dina
kunskaper. En naturlig drivkraft av förbättringsarbete är önskvärt. Goda
kunskaper i svenska och engelska, både muntligt och skriftligt krävs.****

*Övriga upplysningar**
*Tjänsten är en visstidsanställning på två år på heltid med tillträde
enligt överenskommelse. Vill du veta mer om tjänsten är du välkommen att
kontakta enhetschef Erland Holmberg på telefon 08-457 25 20. Fackliga
företrädare är Mathilda Lindberg, SACO, 724 77 (facket-saco at smi.se), Anita
Ekner, ST, 724 50 (anita.ekner at smi.se) och Margareta Thorhagen,
Vårdförbundet, 725 72 (margareta.thorhagen at smi.se)****

Sök tjänsten via vår hemsida senaste den 21 december 2012****

*Molekylärbiolog*

*Smittskyddsinstitutet (SMI) är en statlig myndighet under
Socialdepartementet med ansvar för smittskyddet och med ett brett
folkhälsoperspektiv. SMI ska genom kunskapsuppbyggnad och kunskapsspridning
främja befolkningens skydd mot smittsamma sjukdomar och bidra till att
landets smittskydd fungerar effektivt.*****

Avdelningen för diagnostik och vaccin söker en molekylärbiolog med
placering på enheten för support. Enheten fungerar som en supportfunktion
för myndigheten och ansvarar för sekvensering, massiv parallellsekvensering
(MPS), PCR, rt-PCR, extraktion av nukleinsyra, masspektrometri och
provmottagning. Enheten är även drivande i förbättringsarbetet rörande
molekylär diagnostik. Inom supportenheten ligger genomikplattformen som har
visionen att snabbt och effektivt kunna agera då kända och okända
smittämnen drabbar Sverige. Ett mål är att snabbt kunna sekvensera ett
genom med massiv parallellsekvensering (MPS), extrahera viktig information,
identifiera specifika biomarkörer och skapa en PCR eller qPCR-metod för
snabb och billig analys inom diagnostiken.****

*Arbetsuppgifter**
*Din huvuduppgift kommer att arbeta inom enhetens verksamhet med MPS och
arbeta med en Next Generation Sequencing (NGS) platform (Ion Torrent PGM).
Andra arbetsuppgifter inom plattformen som Sangersekvensering, och PCR samt
pre- och post PCR arbete är även självklara ingredienser bland dina
uppgifter. Du kommer även att vara delaktig i det ständiga
förbättringsarbete som skall genomsyra verksamheten.****

*Kompetens**
*Vi söker dig som är kunnig inom MPS-fältet och som aktivt kan driva
uppbyggnaden av enhetens MPS-arbete. Det rör allt från förberedelser innan
sekvensering till själva sekvenseringen med MPS. Du är utbildad
mikrobiolog/molekylärbiolog och har erfarenhet av arbete med rt-PCR, PCR,
och sekvensering. Vi lägger stor vikt vid dina personliga egenskaper och vi
söker dig som är noggrann, flexibel samt har goda samarbetsegenskaper.
Tidigare arbete med LIMS är meriterande. En naturlig drivkraft av
förbättringsarbete är önskvärt. Goda kunskaper i engelska, både muntligt
och skriftligt krävs.****

*Övriga upplysningar**
*Tjänsten är en visstidsanställning på heltid i två år med tillträde enligt
överenskommelse. Vill du veta mer om tjänsten är du välkommen att kontakta
enhetschef Erland Holmberg på telefon 08-457 25 20. Fackliga företrädare är
Mathilda Lindberg, SACO, 724 77 (facket-saco at smi.se), Anita Ekner, ST, 724
50 (anita.ekner at smi.se) och Margareta Thorhagen, Vårdförbundet, 725 72 (
margareta.thorhagen at smi.se)****

Sök tjänsten via vår hemsida senaste den 21 december 2012****

*Molekylärbiolog*

*Smittskyddsinstitutet (SMI) är en statlig myndighet under
Socialdepartementet med ansvar för smittskyddet och med ett brett
folkhälsoperspektiv. SMI ska genom kunskapsuppbyggnad och kunskapsspridning
främja befolkningens skydd mot smittsamma sjukdomar och bidra till att
landets smittskydd fungerar effektivt.*****

Avdelningen för diagnostik och vaccin söker en molekylärbiolog med
placering på enheten för support. Enheten fungerar som en supportfunktion
för myndigheten och ansvarar för sekvensering, massiv parallellsekvensering
(MPS), PCR, rt-PCR, extraktion av nukleinsyra, masspektrometri och
provmottagning. Enheten är även drivande i förbättringsarbetet rörande
molekylär diagnostik. Inom supportenheten ligger genomikplattformen som har
visionen att snabbt och effektivt kunna agera då kända och okända
smittämnen drabbar Sverige. Ett mål är att snabbt kunna sekvensera ett
genom med massiv parallellsekvensering (MPS), extrahera viktig information,
identifiera specifika biomarkörer och skapa en PCR eller qPCR-metod för
snabb och billig analys inom diagnostiken.****

*Arbetsuppgifter**
*Din huvuduppgift kommer att arbeta och ansvara för enhetens verksamhet med
PCR. Du kommer även att vara delaktig i det ständiga förbättringsarbete som
skall genomsyra enhetens verksamhet.****

*Kompetens**
*Vi söker en expert med gedigen, lång och dokumenterad erfarenhet att
etablera nya PCR och realtids-PCR metoder eftersom vi snabbt kommer att
vilja sätta upp diagnostiska metoder för nya och farliga smittämnen. Du har
relevant universitetsutbildning, följer utvecklingen inom fältet och har
goda externa kontakter. Vi lägger stor vikt vid dina personliga egenskaper
och vi söker dig som är kvalitetsmedveten, driven och självgående med goda
samarbetsegenskaper. Du har även ett stort intresse för utvecklingsarbete
samt vilja och förmåga att dela med dig av din kunskap. Goda kunskaper i
engelska, både muntligt och skriftligt krävs.* *****

*Övriga upplysningar**
*Tjänsten är en tillsvidareanställning på heltid som inleds med sex
månaders provanställning. Vill du veta mer om tjänsten är du välkommen att
kontakta enhetschef Erland Holmberg på telefon 08-457 25 20. Fackliga
företrädare är Mathilda Lindberg, SACO, 724 77 (facket-saco at smi.se), Anita
Ekner, ST, 724 50 (anita.ekner at smi.se) och Margareta Thorhagen,
Vårdförbundet, 725 72 (margareta.thorhagen at smi.se)****

Sök tjänsten via vår hemsida senaste den 21 december 2012****

** **

-- 
Assistant Professor
SciLifeLab
School of Biotechnology
KTH Royal Institute of Technology
Stockholm, Sweden
Email: anders.andersson at scilifelab.se
Phone: +46-8-5248-1414; +46-73-9838962
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: https://mail.sbc.su.se/pipermail/socbin/attachments/20121203/ebedeefb/attachment.html 