[SocBiN] nano-CAGE, eRNA & postdocs

[Albin Sandelin]

On Oct 31, 2013, at 1:08 PM, Robert Månsson <robert.mansson at ki.se> wrote:

> Hej Albin,
> 
> Vi träffades som hastigast när du höll föredrag på KI/Huddinge för ett tag sen. Jag är en av stackarna på HERM som delar kontor med Julian Walfridsson.
> 
> Hade två grejor på tapeten här.
> 
> Skulle vilja kunna titta på eRNA i hematopoietiska stam/progenitor celler och du visade ju snyggt att man ser det i CAGE datan. Har du någon uppfattning om man kan få ut samma data från någon variant av nano-CAGE (vi är intresserade av hematopoietiska protenitorer så ug RNA är inte att prata om) och är det något som du skulle vara intresserad av att ge dig på?
> 
Vi har inte kollat på det specifikt, men jag är tveksam till om man ser det, för metoden är oerhört mycket mer noisy än CAGE - det är ganska likt RNA-seq. Så, nej, inte speciellt intresserad…med CAGE kan man teoretiskt set komma ner till 300 ng, men då ska RNA vara extremt bra, och det sker is stort  sett bara i cellinjer. Du kan också snacka med Carsten Daub på KI  som är på ungefär samma nivå som mig med CAGE. 


> 
> Och sen eftersom jag ändå skriver till dig. Är på G att rekrytera två postdocs till (en bioinformatiker och en molekylärbiolog om möjligt). Du råkar inte ha någon att rekommendera?
> 
> Annonserna är här:
> https://ki.mynetworkglobal.com/en/what:job/jobID:27254/where:4/
> 
> https://ki.mynetworkglobal.com/en/what:job/jobID:27253/where:4/
> 
> 
Inte rakt av, men jag har just lag upp det på vårt student-linkedin-grupp. Du kan också testa "socbin at sbc.su.se" <socbin at sbc.su.se>
 som är en mailinglista för nordiska bioinformatikgrupper (och en massa andra).

Mvh, 
Albin


> Tackar på förhand!
> 
> MVH / Robert
> 
> 
> 
> Robert Mansson
> Assistant Professor
> Karolinska Institute
> Center for Hematology and Regenerative Medicine (HERM)
> Novum (4th floor)
> Hälsovägen 7
> SE-141 57 Huddinge
> Sweden
> Office: +46 (0)8 585 83623
> Mobile: +46 (0)733 140128

-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.su.se/pipermail/socbin-at-sbc.su.se/attachments/20131031/f0fbcc1d/attachment.html>